Tu achètes une licence Windows pas une licence IE. IE est disponible gratuitement sur Internet. Donc oui c'est la même compagnie mais techniquement IE est une software mis gratuitement à disposition sur internet, tout comme Acrobat Reader, Zone Alarm (pas pro), Skype, Winamp, etc (évidement ces compagnies y trouvent un intérêt mais tu ne les payes pas forcément)
Je me fais l'avocat du diable mais si on a découvert plus de failles de sécurtié avec IE qu'avec les autres navigateurs c'est principalement parce que plus de gens l'utilisent. De la même façon il a plus de virus pour Windows que pour Linux ou MacOS X tout simplement parce que leur créateurs veulent toucher un maximum de personnes.
N.B Ca m'empèche pas d'avoir abandonné IE

Pour ceux qui veulent totalement erradiquer IE (même si ça n'est pas recommandé) il est possible d'utiliser la mise à jour automatique de Windows Update sans IE